Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms