Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scarf1Q5ND28 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms