Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms