Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms