Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms