Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1nQ497L1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms