Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms