Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ulk4Q3V129 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ulk4Q3V129 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms