Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms