Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV31

Rnf223, RING finger protein 223, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf223Q3UV31 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms