Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skap1Q3UUV5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms