Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms