Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Arhgef40Q3UPH7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef40Q3UPH7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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