Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms