Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nom1Q3UFM5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms