Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms