Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc174Q3U155 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms