Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc9Q3U0M1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms