Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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H2-M3Q31093 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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H2-M3Q31093 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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H2-M3Q31093 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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H2-M3Q31093 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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H2-M3Q31093 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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H2-M3Q31093 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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H2-M3Q31093 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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