Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd300lgQ1ERP8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms