Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms