Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms