Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms