Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms