Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
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Ttc21bQ0HA38 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms