Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf541Q0GGX2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms