Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms