Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms