Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hspg2Q05793 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hspg2Q05793 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hspg2Q05793 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hspg2Q05793 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hspg2Q05793 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hspg2Q05793 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hspg2Q05793 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hspg2Q05793 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hspg2Q05793 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hspg2Q05793 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hspg2Q05793 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hspg2Q05793 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hspg2Q05793 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hspg2Q05793 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hspg2Q05793 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hspg2Q05793 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hspg2Q05793 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hspg2Q05793 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hspg2Q05793 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hspg2Q05793 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hspg2Q05793 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hspg2Q05793 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms