Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms