Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms