Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms