Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms