Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RykQ01887 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RykQ01887 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RykQ01887 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RykQ01887 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RykQ01887 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RykQ01887 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RykQ01887 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RykQ01887 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RykQ01887 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RykQ01887 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RykQ01887 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RykQ01887 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RykQ01887 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RykQ01887 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RykQ01887 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RykQ01887 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RykQ01887 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RykQ01887 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RykQ01887 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RykQ01887 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RykQ01887 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RykQ01887 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RykQ01887 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RykQ01887 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RykQ01887 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RykQ01887 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RykQ01887 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RykQ01887 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RykQ01887 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RykQ01887 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RykQ01887 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RykQ01887 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RykQ01887 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RykQ01887 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RykQ01887 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RykQ01887 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RykQ01887 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RykQ01887 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RykQ01887 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RykQ01887 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RykQ01887 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RykQ01887 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RykQ01887 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RykQ01887 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RykQ01887 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RykQ01887 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RykQ01887 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RykQ01887 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RykQ01887 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RykQ01887 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RykQ01887 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RykQ01887 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RykQ01887 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RykQ01887 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RykQ01887 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RykQ01887 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RykQ01887 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RykQ01887 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RykQ01887 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RykQ01887 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RykQ01887 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RykQ01887 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RykQ01887 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RykQ01887 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RykQ01887 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RykQ01887 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RykQ01887 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RykQ01887 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RykQ01887 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RykQ01887 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RykQ01887 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RykQ01887 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RykQ01887 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RykQ01887 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RykQ01887 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RykQ01887 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RykQ01887 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RykQ01887 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RykQ01887 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RykQ01887 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RykQ01887 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RykQ01887 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RykQ01887 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RykQ01887 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RykQ01887 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RykQ01887 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RykQ01887 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RykQ01887 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RykQ01887 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RykQ01887 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RykQ01887 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RykQ01887 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RykQ01887 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RykQ01887 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RykQ01887 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RykQ01887 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RykQ01887 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RykQ01887 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RykQ01887 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms