Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HmgcrQ01237 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms