Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Grin2bQ01097 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grin2bQ01097 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms