Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms