Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms