Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IhhP97812 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IhhP97812 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IhhP97812 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IhhP97812 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IhhP97812 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IhhP97812 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IhhP97812 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IhhP97812 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IhhP97812 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IhhP97812 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IhhP97812 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IhhP97812 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IhhP97812 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IhhP97812 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IhhP97812 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IhhP97812 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IhhP97812 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IhhP97812 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IhhP97812 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IhhP97812 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IhhP97812 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IhhP97812 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IhhP97812 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IhhP97812 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IhhP97812 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IhhP97812 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IhhP97812 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IhhP97812 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IhhP97812 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IhhP97812 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IhhP97812 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IhhP97812 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IhhP97812 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IhhP97812 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IhhP97812 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IhhP97812 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IhhP97812 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IhhP97812 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IhhP97812 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IhhP97812 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IhhP97812 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IhhP97812 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IhhP97812 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IhhP97812 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IhhP97812 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IhhP97812 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IhhP97812 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IhhP97812 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IhhP97812 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IhhP97812 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IhhP97812 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IhhP97812 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IhhP97812 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IhhP97812 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IhhP97812 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IhhP97812 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IhhP97812 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms