Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
rp9P97762 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
rp9P97762 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
rp9P97762 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
rp9P97762 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
rp9P97762 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
rp9P97762 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
rp9P97762 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
rp9P97762 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
rp9P97762 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
rp9P97762 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
rp9P97762 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
rp9P97762 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
rp9P97762 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
rp9P97762 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
rp9P97762 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
rp9P97762 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
rp9P97762 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
rp9P97762 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
rp9P97762 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
rp9P97762 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
rp9P97762 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
rp9P97762 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
rp9P97762 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
rp9P97762 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
rp9P97762 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
rp9P97762 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
rp9P97762 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
rp9P97762 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
rp9P97762 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
rp9P97762 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
rp9P97762 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
rp9P97762 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
rp9P97762 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
rp9P97762 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
rp9P97762 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms