Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mesp1P97309 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms