Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tp53bp1P70399 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tp53bp1P70399 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tp53bp1P70399 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tp53bp1P70399 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tp53bp1P70399 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tp53bp1P70399 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Tp53bp1P70399 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Tp53bp1P70399 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Tp53bp1P70399 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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