Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad1P70340 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad1P70340 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad1P70340 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad1P70340 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad1P70340 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms