Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb13P70321 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms