Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf5P70191 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf5P70191 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms