Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UbdP63072 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UbdP63072 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UbdP63072 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UbdP63072 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UbdP63072 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UbdP63072 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UbdP63072 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UbdP63072 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
UbdP63072 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UbdP63072 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UbdP63072 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UbdP63072 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
UbdP63072 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UbdP63072 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
UbdP63072 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UbdP63072 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UbdP63072 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
UbdP63072 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
UbdP63072 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UbdP63072 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UbdP63072 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UbdP63072 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UbdP63072 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UbdP63072 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UbdP63072 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
UbdP63072 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
UbdP63072 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UbdP63072 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UbdP63072 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UbdP63072 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UbdP63072 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UbdP63072 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UbdP63072 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UbdP63072 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UbdP63072 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
UbdP63072 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UbdP63072 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UbdP63072 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UbdP63072 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UbdP63072 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UbdP63072 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UbdP63072 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UbdP63072 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UbdP63072 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UbdP63072 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UbdP63072 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UbdP63072 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UbdP63072 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
UbdP63072 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UbdP63072 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UbdP63072 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UbdP63072 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UbdP63072 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UbdP63072 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UbdP63072 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UbdP63072 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
UbdP63072 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
UbdP63072 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
UbdP63072 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
UbdP63072 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
UbdP63072 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
UbdP63072 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
UbdP63072 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
UbdP63072 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UbdP63072 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UbdP63072 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms