Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms