Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl18aP62717 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl18aP62717 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms