Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms