Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms